Devido ao multiverso fraturado criado por Neo Cortex e Dr. N. Tropy, Crash e a galera serão lançados por toda a linha do tempo. As fases no jogo são divididas em 10 dimensões, cada uma acontecendo em seu próprio tempo e espaço.
- Ilha N.Sanity (presente)
- Deserto de Lixo (2084)
- Cais do Marujo (1717)
- Cataratas do Sossego (1402)
- Pântano do Mosquito (alguns dias atrás)
- A 11ª Dimensão (1954)
- Dimensão dos Dinos (88 Million a.E.C.)
- Órbita de Bermugula (???)
- A Dimensão Sn@xx (3032)
- Ilha do Cortex (1996)
Existem também quatro tipos diferentes de fases que podem ser jogadas dentro de cada dimensão.
- Caminho Principal: Estas são as fases principais, com a progressão da história geral do Crash e seus amigos.
- Chefe: A cada duas dimensões, você vai encontrar uma fase de luta contra um chefe. Você deve derrotar o chefe para continuar progredindo.
- Linha do tempo: Depois de completar algumas fases do caminho principal, você vai liberar uma linha do tempo alternativa, fases secundárias que são jogadas com outros personagens que não Crash ou Coco.
- Flashback: Colete fitas de Flashback nas fases do caminho principal para liberar os flashbacks, fases secundárias jogadas com a perspectiva de rolagem lateral clássica.